Dans un souci de démarche expérimentale plus responsable, le projet MICROTOOL propose d’explorer une nouvelle approche exploitant le microbiote en tant qu’outil non invasif pouvant refléter l’état de santé des organismes. L’objectif principal de MICROTOOL est d’évaluer la modulation du microbiote associé à l’hémolymphe chez la moule Mytilus edulis et du microbiote associé au mucus cutané chez le bar Dicentrarchus labrax après une exposition à deux contaminants émergents.  MICROTOOL vise à répondre à trois questionnements scientifiques :
1) Le microbiote de l'hémolymphe chez les moules et le microbiote du mucus cutané chez le bar peuvent-ils être modulés par les xénobiotiques ?
2) Peut-on identifier des empreintes spécifiques du microbiote en réponse à la contamination ?
3) Peut-on établir un lien entre la modulation du microbiote et l'état de santé de nos organismes ?